生物防治是利用物种间的相互关系，以一种或一类生物抑制另一种或另一类生物的方法，它是降低杂草和害虫等有害生物种群密度的一种方法。
对环境污染小，能有效保护天敌。发挥持续控灾作用，成本低、对人畜安全、害虫不易产生抗性、减少化学农药用量、节约能源。
生物防治包括以虫治虫、以菌治虫、以病毒治虫、以鸟治虫、以蛛螨类治虫、以激素治虫、以菌治菌等措施。
以虫治虫——利用有益的昆虫消灭害虫的方式。如：松毛虫赤眼蜂（寄生性天敌）防治玉米螟、异色瓢虫（捕食性天敌）防治蚜等。
以菌治虫、以菌除草——利用害虫或杂草的病原微生物防治害虫与杂草的方式。如：白僵菌（真菌）防治鳞翅目害虫；苏云金杆菌（细菌）防治鳞翅目害虫、“鲁保一号”防治兔丝子等。
以病毒治虫——核型多角体病毒(NPV)、颗粒体病毒(GV)和质型多角体病毒(CPV)防治鳞翅目、双翅目、膜翅目、鞘翅目等的幼虫。
以鸟（家禽）治虫——如：新疆维吾尔自治区利用椋鸟防治蝗虫、散养鸭防治草原蝗虫等。
以蛛（螨）类治虫——如：利用棒络新妇（蜘蛛类）防治桃蚜；利用胡瓜钝绥螨、智利小植绥螨（捕食螨）防治红蜘蛛。
以激素治虫——利用雌虫的信息素诱集雄虫的方法。如：小菜蛾性诱芯诱集小菜蛾等。
以菌治菌——某些微生物(益菌)在生长发育过程中能分泌一些抗菌物质，抑制其他微生物的生长，这种现象称拮抗作用。利用有拮抗作用的微生物防治园林植物病害，有的已获得成功，如利用哈氏木霉菌防治白绢病。目前，以菌治病多用于土壤传播的病害。
病毒病作为世界性的难题，不管是动物病毒还是植物病毒，都没有特效药。病毒病发生后，目前较为有效的措施是通过养护叶片、根系，增强植株长势，提高蔬菜自身抗性，并调控环境条件，最好的结果就是使病毒病从显症状态进入隐症状态，减轻病毒病的为害。
病毒病的防治药剂中，以部分植物源农药效果较好，如苦参碱、蛇床子素等，既可以有效防治蚜虫、粉虱等传毒害虫，减少病毒病传播，又能直接抑制病毒病增殖，减轻病毒病为害，是当前防治病毒病使用的主要药剂。
除植物源农药外，很多生物农药也是病毒病防治中必不可少的药剂，如核苷酸、甘氨酸、脂肪酸、菇类蛋白、氨基寡糖素等，既可以补充叶片养分，诱导植株提高抗性，又可以在叶片表面形成保护膜，减少病毒病传播的几率。
部分抗生素对病毒病有一定效果，如宁南霉素、嘧肽霉素、病毒克星等，可以在一定程度上抑制病毒病增殖。
病毒病发生后，用病毒克星加植物生长调节剂以及螯合锌叶面肥，养护为主，切断病毒传播途径为辅，对病毒病有较好的防治效果。
